Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc159Q8C963 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc159Q8C963 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms