Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfibp1Q8C8U0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfibp1Q8C8U0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfibp1Q8C8U0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms