Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alx1Q8C8B0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Alx1Q8C8B0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Alx1Q8C8B0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms