Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik4Q8BMF5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms