Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnrc6bQ8BKI2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms