Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
6820408C15RikQ8BJX2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
6820408C15RikQ8BJX2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
6820408C15RikQ8BJX2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms