Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI36

Jkamp, JNK1/MAPK8-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JkampQ8BI36 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JkampQ8BI36 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JkampQ8BI36 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms