Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.6Q85ZW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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