Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srgap3Q812A2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srgap3Q812A2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms