Protein–RNA interactions for Protein: Q80WG5

Lrrc8a, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8aQ80WG5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc8aQ80WG5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrc8aQ80WG5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8aQ80WG5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms