Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm2Q80W85 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Npm2Q80W85 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Npm2Q80W85 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Npm2Q80W85 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.7 ms