Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc155Q80VJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc155Q80VJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms