Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd3eapQ76KJ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd3eapQ76KJ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms