Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2r2Q6ZWZ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms