Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RfflQ6ZQM0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RfflQ6ZQM0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RfflQ6ZQM0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms