Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr13Q6R5N8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr13Q6R5N8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr13Q6R5N8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms