Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc82Q6PG04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc82Q6PG04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms