Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trak1Q6PD31 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Trak1Q6PD31 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Trak1Q6PD31 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trak1Q6PD31 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms