Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6PD19 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6PD19 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6PD19 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6PD19 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6PD19 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6PD19 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6PD19 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6PD19 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6PD19 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6PD19 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6PD19 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6PD19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q6PD19 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6PD19 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6PD19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6PD19 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6PD19 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6PD19 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6PD19 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6PD19 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6PD19 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6PD19 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6PD19 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6PD19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6PD19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6PD19 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6PD19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6PD19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6PD19 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6PD19 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q6PD19 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6PD19 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6PD19 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6PD19 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6PD19 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6PD19 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6PD19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6PD19 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms