Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb40Q6PCS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zbtb40Q6PCS8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbtb40Q6PCS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms