Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slf2Q6P9P0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slf2Q6P9P0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf2Q6P9P0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf2Q6P9P0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms