Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krba1Q6NXZ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krba1Q6NXZ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krba1Q6NXZ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms