Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpbp1Q6NXH3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpbp1Q6NXH3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms