Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bfsp2Q6NVD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bfsp2Q6NVD9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms