Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk13Q69ZA1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk13Q69ZA1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms