Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptpn13Q64512 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn13Q64512 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms