Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20917Q62457 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20917Q62457 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20917Q62457 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms