Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms