Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim25Q61510 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms