Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3Q60803 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms