Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms