Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a4Q5XF90 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms