Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myh4Q5SX39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myh4Q5SX39 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Myh4Q5SX39 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms