Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms