Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc92bQ5SUE3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc92bQ5SUE3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92bQ5SUE3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1024 ms