Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tns3Q5SSZ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tns3Q5SSZ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tns3Q5SSZ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tns3Q5SSZ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tns3Q5SSZ5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tns3Q5SSZ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tns3Q5SSZ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tns3Q5SSZ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms