Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Mdc1Q5PSV9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mdc1Q5PSV9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms