Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rapgef6Q5NCJ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rapgef6Q5NCJ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Rapgef6Q5NCJ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms