Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc1Q5NCF2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms