Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1810065E05RikQ5NC41 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1810065E05RikQ5NC41 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
1810065E05RikQ5NC41 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
1810065E05RikQ5NC41 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms