Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afap1l2Q5DTU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afap1l2Q5DTU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afap1l2Q5DTU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms