Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN45

UPF0691 protein C9orf116 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5BN45 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5BN45 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5BN45 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5BN45 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5BN45 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5BN45 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q5BN45 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q5BN45 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q5BN45 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q5BN45 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q5BN45 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q5BN45 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5BN45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5BN45 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q5BN45 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5BN45 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5BN45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms