Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spsb3Q571F5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms