Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spire1Q52KF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spire1Q52KF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms