Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc9a2Q3ZAS0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc9a2Q3ZAS0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms