Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil2Q3V3V9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms