Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbm44Q3V089 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbm44Q3V089 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm44Q3V089 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms