Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SfswapQ3USH5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SfswapQ3USH5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms