Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Lmod2Q3UHZ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lmod2Q3UHZ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lmod2Q3UHZ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms