Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tespa1Q3U132 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tespa1Q3U132 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms