Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TraddQ3U0V2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TraddQ3U0V2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TraddQ3U0V2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TraddQ3U0V2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TraddQ3U0V2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TraddQ3U0V2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TraddQ3U0V2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TraddQ3U0V2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms